Rotmappen (rotpartisjonen på disken, roten til den logiske partisjonen på disken, rotkatalogen) kalles vanligvis en sekvensiell katalog med de logiske egenskapene til alle filer og mapper som er lagret i den valgte gruppen.

Oppretting av rotmapper utføres automatisk under formatering av volumpartisjon. Den fysiske plasseringen av rotpartisjonen skjer bak FAT-sikkerhetskopien. Ethvert objekt fra roten til en logisk partisjon er preget av flere sekvenser på 32 eller 64 byte, som inkluderer: - sti til "begynnelsen" av det valgte filobjektet (adresse til den første klyngen); - objektnavn; - objekt attributter (system, skjult, arkiv); - dato for oppretting av objekt; - tidspunkt for oppretting av objekt; - objektstørrelse osv. Diskstrukturen som vises i Windows Utforsker er nesten helt hentet fra rotmappen. Følgende objekter i rotpartisjonen er av største interesse for brukeren: - boot.ini - systemstartfil. Er skjult. Det er nødvendig å installere operativsystemet og kan ikke endres med mindre det er absolutt nødvendig; - pagefile.sys - hvis det er umulig å lagre visse deler av programmer og informasjonsfiler i datamaskinens RAM, er denne skjulte filen ment å imøtekomme de nødvendige dataene; - hiberfil.sys - lar deg bruke funksjonen dvalemodus, lagre all dataminnedata på harddisken ved avslutning og gjenopprette lagret informasjon når du gjenopptar arbeidet; - resirkulering - en skjult mappe designet for å lagre slettede data; - Systemvoluminformasjon - en skjult mappe som brukes til å lagre systembufferen og kopier av systemregistret. Informasjonen i denne mappen er nødvendig for å utføre systemgjenopprettingsprosedyren. Informasjon fra gjenopprettingspunkter er inneholdt i _restore {GUID} -undermappene til RPxSnapshot; - Dokumenter og innstillinger - mappen brukes til å lagre brukerprofildata.